隨著(zhù)三峽工程175米蓄水，三峽水庫轉入后續管理階段，三峽庫區的環(huán)境保護成為全國重點(diǎn)流域環(huán)境保護的重中之重。近年來(lái)，重慶市積極探索健全完善三峽庫區水環(huán)境保護長(cháng)效機制，三峽庫區環(huán)境保護工作取得積極成效，庫區水質(zhì)經(jīng)受住了蓄水以來(lái)的時(shí)間考驗。
一是大力推進(jìn)環(huán)境基礎設施建設。在國家的支持下，重慶市生活污染治理項目建設進(jìn)度加快。到2009年底，全市已累計建成94個(gè)生活污水處理廠(chǎng)（含分散型小城鎮污水處理廠(chǎng)）和48座垃圾處理場(chǎng)，全市城市生活污水集中處理率和生活垃圾處理無(wú)害化處理率分別達到79%和89%，其中庫區已分別達到84%和94%，遠高于全國平均水平。
二是不斷加大庫區工業(yè)污染防治力度。制定了《工業(yè)項目環(huán)境準入規定》，防止有重大環(huán)境風(fēng)險項目進(jìn)入庫區，引導工業(yè)企業(yè)向工業(yè)園區集中，堅持集中控制工業(yè)污染、集中防范工業(yè)項目環(huán)境風(fēng)險。完成了淹沒(méi)工礦企業(yè)搬遷調整任務(wù)，完成了主城區66戶(hù)企業(yè)環(huán)保搬遷。開(kāi)展造紙、電鍍、電解錳、碳酸鍶等行業(yè)的專(zhuān)項整治，強化了化工行業(yè)環(huán)境安全檢查。
三是切實(shí)加強庫區飲用水源保護。近年來(lái)，重慶市每年都將飲用水源保護列為市委、市政府“民心工程”，予以重點(diǎn)推進(jìn)。清理了飲用水源保護區范圍的所有工業(yè)污染源、市政排污口和餐飲娛樂(lè )船，完成了全市500人以上集中式飲用水源保護區的劃定工作。禁止在三峽庫區水體水域進(jìn)行網(wǎng)箱、網(wǎng)欄養殖，開(kāi)展了三峽庫區水產(chǎn)養殖專(zhuān)項執法行動(dòng)。
四是認真做好庫底固體廢物清理和漂浮物清撈。圓滿(mǎn)完成三峽庫區二、三、四期庫底固體廢物的清理，清理處置生活垃圾306萬(wàn)噸，清理處置一般工業(yè)固廢260萬(wàn)噸，清理危險廢物1.9萬(wàn)噸，清理處置廢放射源18枚。三峽水庫蓄水以來(lái)，我市財政累計安排清漂經(jīng)費1.46億元，配備31艘機械化清漂船和27輛垃圾壓縮式運輸車(chē)，清理漂浮垃圾58萬(wàn)余噸。尤其是三峽工程175米試驗性蓄水期間，全市組織了“萬(wàn)人清漂大突擊活動(dòng)”，2個(gè)月清理漂浮物10萬(wàn)余噸，緩解了三峽壩前清漂壓力，確保了庫區蓄水的安全和水域的清潔。
五是努力積極推進(jìn)次級河流污染綜合整治。完成了主城區桃花溪流域綜合整治工作，水環(huán)境質(zhì)量顯著(zhù)改善。列入《三峽庫區及其上游水污染防治規劃（修訂本）》（以下簡(jiǎn)稱(chēng)《規劃修訂本》）的8條示范項目，有2條（苧溪河和梁灘河）開(kāi)工建設，2條（瀨溪河、桃花河）已上報國家發(fā)改委審查概算，其余4條正在開(kāi)展前期工作。
六是扎實(shí)開(kāi)展庫區船舶污染治理。新建造船舶全部安裝了生活污水處理裝置，老船舶分期分批實(shí)施治理。在主城、萬(wàn)州、巫山等主要客運港區設置了固體垃圾接收船舶，庫區30馬力以上的運輸船舶按要求配備了油水分離設備和污油水儲存裝置,約600艘船舶安裝了一體化生化處理裝置。
七是深入開(kāi)展農村面源污染防治。近年來(lái)，三峽庫區累計投入4.76億元，發(fā)展農村戶(hù)用沼氣53.14萬(wàn)戶(hù)，庫區農村戶(hù)用沼氣占庫區總農戶(hù)的15.5%，建成畜禽養殖場(chǎng)沼氣工程550處，促進(jìn)畜禽糞污的資源化利用和無(wú)害化處理，形成了能源生態(tài)型和能源環(huán)保型等多種養殖場(chǎng)污染治理模式。加強生態(tài)農業(yè)建設，推廣實(shí)施測土配方施肥，庫區生態(tài)農業(yè)試點(diǎn)示范區縣建設擴大到15個(gè)。
八是推進(jìn)實(shí)施消落帶生態(tài)環(huán)境保護。開(kāi)展了消落帶環(huán)境問(wèn)題研究，啟動(dòng)了開(kāi)縣水位調節壩工程、奉節朱衣河胡家壩消落帶環(huán)境綜合整治工程、巫山小三峽生態(tài)保護項目、巫溪王家河護岸工程等一批消落帶生態(tài)環(huán)境保護試點(diǎn)示范工程，實(shí)施了“三峽庫區消落帶生態(tài)恢復與綜合整治技術(shù)與示范”和“三峽庫區水土流失與面源污染控制試驗示范”等科技支撐項目，開(kāi)展了消落區耐淹植物栽培試驗。
三峽工程蓄水以來(lái)，庫區水環(huán)境質(zhì)量總體保持穩定，長(cháng)江、嘉陵江和烏江重慶段水質(zhì)滿(mǎn)足Ⅱ類(lèi)斷面比例逐年上升。今年上半年，長(cháng)江、嘉陵江和烏江重慶段8個(gè)國控監測斷面水質(zhì)、國控飲用水源地和城鎮集中式飲用水源地水質(zhì)均全部滿(mǎn)足水域功能要求;次級河流水質(zhì)滿(mǎn)足水域功能要求的斷面比例達到79.6%；長(cháng)江出境斷面水質(zhì)到達Ⅱ類(lèi)水質(zhì)標準，庫區水質(zhì)經(jīng)受住了蓄水以來(lái)的時(shí)間考驗。
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